Prolin finnes ofte på slutten av α-helix eller i svinger eller løkker. I motsetning til andre aminosyrer som nesten utelukkende eksisterer i transformasjonen i polypeptider, kan prolin eksistere i cis-konfigurasjonen i peptider.
Inneholder alfaspiraler prolinrester?
Nå som det er over 30 000 proteinstrukturer i proteindatabanken, er det klart at prolinrester er tilstede i α-helikser, der de ofte spiller viktige roller i proteinets struktur og funksjon.
Hvilke aminosyrer er i alfaspiraler?
Enhver av de 20 aminosyrene kan delta i en α-helix, men noen er mer foretrukket enn andre. Ala, Glu, Leu og Met finnes oftest i helikser, mens Gly, Tyr, Ser og Pro er mindre sannsynlig å bli sett.
Inneholder betaark prolin?
Proline er ikke foretrukket i betaarkstrukturer siden det ikke kan fullføre H-bindingsnettverket. Når prolin forekommer i ark, kan det være i en bule eller arkkant der mangelen på en aminohydrogenbindingsdoner ikke er kritisk.
Hva inneholder alfahelikser?
Alfa-helixen (α-helix) er et vanlig motiv i den sekundære strukturen til proteiner og er en høyre-helix-konformasjon der hver ryggrad N−H-gruppe hydrogen bindes til ryggraden C=O. gruppe av aminosyren lokalisert fire rester tidligere langs proteinsekvensen.