Hvor finnes DNase I-overfølsomhetssteder og hva indikerer de om kromatinets natur? Disse stedene finnes ved ekson-intron-kryssene og indikerer stedet for mRNA-sp alting under spleising. Disse stedene er tilfeldig funnet i hele genomet, og det gjør DNA sårbart for nedbrytning.
Hva er et DNase I-overfølsomt nettsted og hvordan påvirker det kromatin?
I genetikk er DNase I hypersensitive sites (DHSs) regioner av kromatin som er følsomme for sp altning av DNase I-enzymet. I disse spesifikke områdene av genomet har kromatin mistet sin kondenserte struktur, eksponert DNA og gjort det tilgjengelig.
Hva foreslår et DNase-overfølsomt nettsted?
Aktive cis-regulatoriske elementer er overfølsomme for sp altning av endonukleasen DNase I. Motiver innenfor DNase I-hypersensitive steder indikerer potensiell trans-virkende faktorbelegg og, når kombinert med DNase I sp altningsdata, kan brukes til å konstruere provisoriske regulatoriske nettverk.
Hva er DNase-overfølsomhetsanalyse?
I mer enn to tiår har DNase I-hypersensitivitetsanalysen (DHA) vært instrumentell for å oppdage regulatoriske domener (11). Denne metoden kartlegger diskrete steder i genomet der konformasjonen av kromatin gjør DNA-et overfølsomt for sp altning av endonukleasen DNase I (12).
Hva er et nuklease-overfølsomt sted i kromatin?
Innkromatin, nukleosomfrie regioner kjent som nuklease-overfølsomme steder antas å representere de "åpne vinduene" som tillater forbedret tilgang til viktige residente cis-virkende DNA-sekvenser til transvirkende faktorer (se ref..