Derimot faller de fleste eukaryote DNA-ligaser, sammen med arkeale og bakteriofagenzymer, inn i den andre underfamilien; disse enzymene bruker ATP som en kofaktor.
Krever ligaser ATP?
To DNA-ligaser er ofte brukt. … T4-ligase krever ATP mens E. coli-ligase krever NAD+ (Nikotinamid-adenindinukleotid er et koenzym som består av 2 nt sammenføyd gjennom fosfatgruppene deres). Begge katalyserer sammenføyningen av en 5'-fosfat- og en 3'-OH-gruppe for å danne en fosfodiesterbinding.
Hvorfor trenger ligaser ATP?
De to trinnene i DNA-ligeringsreaksjonen
DNA-ligeringsreaksjonen i seg selv har to grunnleggende trinn. For det første DNA-endene må kollidere ved en tilfeldighet og holde sammen lenge nok til at ligasen kan bli med dem. … For å la enzymet utføre ytterligere reaksjoner, må AMP i enzymets aktive sete fylles på med ATP.
Hva er funksjonen til ligaser?
DNA-ligaser spiller en viktig rolle i vedlikeholde genomisk integritet ved å sammenføye brudd i fosfodiester-ryggraden i DNA som oppstår under replikasjon og rekombinasjon, og som en konsekvens av DNA-skade og dens reparere. Tre menneskelige gener, LIG1, LIG3 og LIG4 koder for ATP-avhengige DNA-ligaser.
Hva er ligaser fungerer de aktivt eller passivt?
DNA-ligase er aktiv under replikasjonen, reparasjons- og rekombinasjonsprosessen av DNA. Det er mye brukt i reparasjon av enkelttrådbryter i dupleks-DNA fra levende organismer ved å bruke den komplementære tråden til dobbelthelixen som mal, mens noen former spesifikt kan reparere dobbelttrådskader.
