I molekylærbiologi er STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) en biologisk database og nettressurs med kjente og forutsagte protein-protein-interaksjoner. … Den siste versjonen 11b inneholder informasjon om rundt 24,5 millioner proteiner fra mer enn 5000 organismer.
Hva er formålet med STRING-databasen?
STRING-databasen tar sikte på å samle inn og integrere denne informasjonen, ved å konsolidere kjente og antatte proteiner–proteinassosiasjonsdata for et stort antall organismer.
Hva er en STRING-poengsum?
I STRING er hver protein-protein-interaksjon merket med en eller flere 'score'. Viktigere, disse skårene indikerer ikke styrken eller spesifisiteten til interaksjonen. I stedet er de indikatorer på tillit, dvs. hvor sannsynlig STRING vurderer at en interaksjon er sann, gitt tilgjengelig bevis.
Hvorfor samhandler proteiner?
Protein–protein-interaksjoner (PPIs) er fysiske kontakter med høy spesifisitet etablert mellom to eller flere proteinmolekyler som et resultat av biokjemiske hendelser styrt av interaksjoner som inkluderer elektrostatiske krefter, hydrogen binding og den hydrofobe effekten.
Hva er funksjonell assosiasjon?
definisjon. Binært forhold mellom biologiske enheter når en av dem modulerer den andre når det gjelder funksjon, uttrykk, degradering eller stabilitet til den andre og forholdetmellom partnerne kan ikke fastslås som direkte, så mellomliggende trinn er implisitt tilstede.