Fordi DdNTP-er har et hydrogenmolekyl (-H) i stedet for en hydroksylgruppe (-OH) festet til 3'-C av dens deoksyribose, kan den ikke binde seg til noen innkommende nukleotider. Derfor kan tillegg av DdNTP-er under DNA-replikasjon brukes til å avslutte syntesereaksjonen.
Hvorfor stopper DNA-syntesen når en ddNTP inkorporeres i den voksende DNA-strengen?
Hvis det tilsatte nukleotidet er et "dideoksynukleotid" (Figur 6.29), vil 3'-enden av den voksende strengen nå ha en H, i stedet for en OH. Dette vil forhindre at ytterligere nukleotider legges til; dvs. in vitro DNA-syntese vil stoppe på dette tidspunktet.
Hvordan avslutter en ddNTP DNA-syntese?
Når en ddNTP er inkorporert i en kjede av nukleotider, avsluttes syntesen. Dette er fordi ddNTP-molekylet mangler en 3'-hydroksylgruppe, som er nødvendig for å danne en kobling med neste nukleotid i kjeden.
Hvorfor avslutter DdNTP-er replikeringsprosessen?
Laboratory Methods in Enzymology: DNA
dideoksynukleotid trifosfater er lett inkorporert i en voksende DNA-kjede, men mangler den 3′ hydroksylgruppen som er nødvendig for å la kjeden fortsette, og effektivt avslutte polymerisasjonen.
Hvorfor får dideoksynukleotider til at DNA-replikasjonen stopper?
Disse ddNTP-ene mangler en 3′-OH-gruppe som er nødvendig for dannelsen av en fosfodiesterbinding mellom tonukleotider, noe som får forlengelsen av DNA-tråden til å stoppe når en ddNTP legges til.
