Aktivatorproteiner binder seg til regulatoriske steder på DNA i nærheten til promoterregioner som fungerer som av/på-brytere. Denne bindingen letter RNA-polymeraseaktivitet og transkripsjon av nærliggende gener.
Hvor binder aktivatorer og undertrykkere?
DNA-segmenter nær promotoren fungerer som proteinbindingssteder - de fleste av disse stedene kalles operatører - for regulatoriske proteiner k alt aktivatorer og undertrykkere. For noen gener er bindingen av et aktivatorprotein til mål-DNA-stedet en nødvendig forutsetning for at transkripsjon skal begynne.
Hvor binder en aktivator seg til?
De fleste aktivatorer binder seg til hovedsporene i dobbeltspiralen, siden disse områdene har en tendens til å være bredere, men det er noen som vil binde seg til de mindre sporene. Aktivatorbindingssteder kan være lokalisert svært nær promoteren eller flere basepar unna.
Hva binder aktivatorproteinet seg til?
Delene av et aktivatorprotein: DNA-bindingsdomenet (som festes til gjenkjenningsstedet i DNA) og aktiveringsdomenet, som er "forretningsenden" til aktivatoren som faktisk fremmer transkripsjon, f.eks. ved å lette dannelsen av transkripsjonsinitieringskomplekset.
Hvor vil en aktivator binde seg til denne operonen?
En aktivator binder seg innenfor den regulatoriske regionen til en operon, og hjelper RNA-polymerase med å binde seg til promoteren, og dermedforbedre transkripsjonen av denne operonen. En induktor påvirker transkripsjon gjennom interaksjon med en repressor eller aktivator. trp-operonen er et klassisk eksempel på en undertrykkelig operon.