BLAST kan brukes til flere formål. Disse inkluderer identifisering av arter, lokalisering av domener, etablering av fylogeni, DNA-kartlegging og sammenligning. Med bruk av BLAST kan du muligens riktig identifisere en art eller finne homologe arter.
Hva brukes BLAST til?
BLAST er en datamaskinalgoritme som er tilgjengelig for bruk online på nettstedet til National Center for Biotechnology Information (NCBI), så vel som mange andre nettsteder. BLAST kan raskt justere og sammenligne en søke-DNA-sekvens med en database med sekvenser, noe som gjør den til et kritisk verktøy i pågående genomisk forskning.
Hva er BLAST-teknikk?
BLAST-teknikken er en klageløsningsmetode utviklet av Albert Barneto . Mnemonikken står for Tro, Lytt, Beklager, Tilfredsstill og Takk (Tabell 1). 6. Denne artikkelen beskriver dens nytte i pasientbehandling og som et klinisk undervisningsverktøy.
Hvordan fungerer BLAST DNA?
Hvordan fungerer BLAST? BLAST identifiserer homologe sekvenser ved hjelp av en heuristisk metode som i utgangspunktet finner korte treff mellom to sekvenser; dermed tar ikke metoden hensyn til hele sekvensrommet. Etter den første kampen prøver BLAST å starte lokale justeringer fra disse første kampene.
Hvorfor er BLAST raskere enn Fasta?
Når det gjelder kompleksitet for algoritmekjøring, er BLAST raskere enn FASTA ved å kun søke etter de mer signifikante mønstrene isekvenser. Følsomheten (eller nøyaktigheten) til BLAST og FASTA har en tendens til å være forskjellig for nukleinsyre- og proteinsekvenser (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
