Peptidbindinger har en plan, trans, konfigurasjon og gjennomgår veldig liten rotasjon eller vridning rundt amidbindingen som knytter α-aminonitrogenet til én aminosyre til karbonylkarbonet av de neste (Figur 4-1).
Hvorfor er rotasjon om peptidbindingen forbudt?
Hvorfor er rotasjon om peptidbindingen forbudt, og hva er konsekvensene av manglende rotasjon? Peptidbindingen har delvis dobbeltbindingskarakter, som forhindrer rotasjon. Denne mangelen på rotasjon begrenser konformasjonene til peptidryggraden og begrenser mulige strukturer.
Kan peptidbindinger bøye seg?
Siden ryggraden i polypeptidet, holdt sammen av peptidbindinger, er fleksibel (på grunn av "rotasjonen rundt alle disse bindingene"), kan kjeden bøye seg, vri seg, og bøye seg til et veldig stort utvalg av tredimensjonale former.
Er peptidbindinger reversible?
Selv om peptidbinding dannelse kan reverseres ved tilsetning av vann (hydrolyse), er amidbindinger veldig stabile i vann ved nøytral pH, og hydrolyse av peptidbindinger i celler er også enzymatisk kontrollert.
Har peptidbindinger retningsbestemt?
Selv om geometrien til peptidgruppen er fast, kan bindingene på hver side av alfakarbonene rotere. Dette tillater fleksibilitet i peptidryggraden. … Sekvensen av aminosyrer i proteinet har en retningsbestemt ellerorientering som er definert av funksjonsgruppene i enden av kjeden.
